Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNG1Q06432 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms