Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX1Q04741 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms