Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGD1P98174 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGD1P98174 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD1P98174 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms