Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HBBP68871 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HBBP68871 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBBP68871 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms