Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPCS3P61009 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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