Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBP60709 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms