Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTCP1P56278 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms