Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP98P52948 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms