Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1A1P48729 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms