Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRKLP46109 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRKLP46109 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRKLP46109 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRKLP46109 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRKLP46109 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRKLP46109 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKLP46109 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKLP46109 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKLP46109 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKLP46109 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRKLP46109 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms