Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP2P42575 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms