Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CHRNA7P36544 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms