Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms