Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCM3P25205 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCM3P25205 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCM3P25205 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCM3P25205 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCM3P25205 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCM3P25205 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCM3P25205 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCM3P25205 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCM3P25205 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms