Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3P10147 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms