Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC3A2P08195 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms