Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms