Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms