Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DXG7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DXG7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms