Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYSRT1A8MQ03 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms