Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms