Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FARSAQ9Y285 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms