Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms