Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SHOC2Q9UQ13 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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