Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX7Q9UNH6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms