Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms