Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms