Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms