Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRBP1Q9P2E9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms