Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG3Q9NT62 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms