Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms