Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3GQ9NS98 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms