Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERINC1Q9NRX5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms