Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUFT1Q9NNX1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUFT1Q9NNX1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms