Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms