Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTDSP1Q9GZU7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTDSP1Q9GZU7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTDSP1Q9GZU7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTDSP1Q9GZU7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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