Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CIPCQ9C0C6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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