Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRNKL1Q9BZJ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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