Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM54Q9BYV2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms