Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4AQ9BY43 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms