Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF4Q9BUZ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms