Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCMBPQ9BTE3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms