Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF559Q9BR84 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms