Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SENP8Q96LD8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms