Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms