Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms