Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C18orf8Q96DM3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms