Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APH1AQ96BI3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APH1AQ96BI3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms