Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY2Q8WXA3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY2Q8WXA3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms