Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms